Hakkında
Ben Kader Sarıbulak. Gebze Teknik Üniversitesi Biyomühendislik bölümünden 2023 yılında mezun oldum. Aynı sene içerisinde lisans tezimi birlikte yürüttüğüm Prof.Dr. Tunahan Çakır ile yüksek lisans yapmak amacıyla aynı üniversite de Biyoinformatik ve Sistem Biyolojisi programında yüksek lisansa başladım ve 2025 yılında mezun oldum. Hem lisans hem de yüksek lisans tezimin kapsamı Alzheimer hastalığı ve biyoinformatik & sistem biyolojisi ekseninde dönmektedir. 2024 Ekim itibariyle İdea Teknoloji Çözümleri şirketinde ARGE departmanında mühendis olarak çalışmaya başladım. Bulunduğum şirket İstanbul'da yer almaktadır. Şirket bünyesinde ki çalışmalarım kapsamında birçok TEYDEB ve Özkaynak projelerinde yer almaktayım. Alanlarım; nadir hastalıklar, genetik analiz, biyoinformatik araçlar ve algoritmalar ile DNA & RNA analizleri, genetik mutasyon & CNV analizi, ML ve DL modelleri ile RNA editing tahmin algoritması geliştirme, nadir hastalıklar özelinde hekime asistanlık yapabilecek bir yapay zeka modeli geliştirme projesi, DNA ham verilerinden biyoinformatik iş akışı ile genetik test sonucu üretme gibi birçok tıbbi ve biyoinformatik alanlarının birleştiği projelerde yer almaktayım. 2025 Kasım - 2026 Ocak tarihleri arasında Barcelona Supercomputing Center'da 3 aylık bir ERASMUS staj süreci gerçekleştirmiş ve orada da proteomics üzerinde birçok deneyim kazandığımı belirtebilirim.
Araştırma Alanları
alzheimerbioinformaticsbiyoinformatikdna & rna analizlerifeature selectiongenetik mutasyonmetabolic networknadir hastalıklarpredictionsistem biyolojisisystem biologysystems biologyyapay zeka
Yayınlar
Generation of Alzheimer's Disease Metabolic Models Using Transcriptome Data and Human Genome Scale Metabolic Model and Identification of Significantly Affected Pathways
Tez
2023
SARIBULAK, K., & Çakır, T. (2023). Generation of Alzheimer's Disease Metabolic Models Using Transcriptome Data and Human Genome Scale Metabolic Model and Identification of Significantly Affected Pathways [Tez]. Gebze Teknik Üniversitesi.
Prediction of Metabolite Biomarkers for Alzheimer's Disease Subtypes with an Innovative Algorithm Combining Genome-Scale Metabolic Models with Transcriptome Data
Tez
2025
Sarıbulak, K., & Çakır, T. (2025). Prediction of Metabolite Biomarkers for Alzheimer's Disease Subtypes with an Innovative Algorithm Combining Genome-Scale Metabolic Models with Transcriptome Data [Tez]. Gebze Teknik Üniversitesi.